Em meados do século XX, numa atmosfera de formação e movimento de pensamentos teológicos divergentes que produziam encontros e organizações eclesiásticas pela América e Europa, Carlos Mateus estava no epicentro desses acontecimentos no contexto latino-americano.

As viagens nacionais e internacionais influenciaram o missionário  Carlos Mateus a idealizar uma instituição que também organizasse as igrejas locais recém-estabelecidas no Rio Grande do Norte.

Quatro anos antes da fundação do seminário, Carlos Mateus foi um dos mentores da formação da Associação de Igrejas Batistas Regulares do Rio Grande do Norte. Em 1946, na cidade de São José de Mipibú, deu-se início a organização que se tornou a primeira associação estadual dos Batistas Regulares no Brasil. Contando com a presença de três representantes de três igrejas do estado, cada uma numa cidade diferente (São José de Mipibú, Parnamirim e Lagoa Seca, bairro de Natal) todas iniciadas contando com os esforços evangelísticos do casal Carlos e Adelaide Mateus.